陈祖军，四川遂宁人。
1985年北京大学考古学系毕业。
1985年7月—2007年8月，在四川省文物考古研究院工作。
1994年获得国家文物局田野考古领队资格。
2001年获得文博副研究馆员职称。
2007年9月至今，在西藏自治区文物保护研究所工作。
2009年获得文博研究馆员职称。
2013年9月18日，被批准为西藏自治区学术技术带头人。
先后主持的考古调查与发掘工作主要有：四川省都江堰市紫坪铺水库淹没区文物调查、四川省丹巴县中路乡罕额依遗址考古发掘、三峡库区四川省迁建区文物调查及规划工作、四川省华蓥市南宋安丙家族墓地发掘、四川省大渡河上游2000年度考古调查、四川省宣汉县罗家坝遗址2003年度考古发掘、四川省凉山彝族自治州锦屏一级水电站水库淹没区文物调查、四川省甘孜州乡城县洞松乡克斗村木因石棺墓群抢救性清理、襄渝铁路安康至重庆段增建第二线工程（成都铁路局管段）四川段文物调查、西藏自治区墨脱县文物普查、西藏自治区亚东县清朝亚东海关遗址考古发掘与调查、西藏自治区札达县古格王国遗址洞窟考古调查、西藏自治区波密县波得藏布沿岸考古调查、西藏自治区昌都县小恩达遗址考古调查、勘探与发掘等工作。
先后参加的考古调查、发掘工作主要有：四川省雅安市河北乡沙溪遗址发掘、四川省涪陵地区黔江县冯家坝镇茶花村红土湾老屋基洞与秀山县龙池区涌洞乡野坪村扁口洞旧石器时代考古调查、四川省第二次全国文物普查、三峡水库淹没区四川境内的文物调查、四川省广汉三星堆月亮湾遗址发掘、2002年中日南方丝绸之路联合调查队在四川省阿坝藏族羌族自治州的调查、西藏自治区古水水电站文物调查、西藏自治区第三次全国文物普查、川藏铁路拉萨-林芝段文物调查等工作。
先后发表《略论曲贡文化的分期》、《西南地区的石棺墓分期研究》、《从察隅县华贡山摩崖题刻谈中国中央政府对察隅地区的开发与治理》、《清朝亚东海关遗址发掘及相关遗存调查报告》、《四川武胜山水岩崖墓群发掘报告》、《汉文史料所见川滇藏古道西藏境内路线考——附<西藏程站考>校释》、《拉萨<磨盘山新建关帝庙碑>及铜钟铭文重录与相关问题略考》等专著、报告与论文50余篇。
主要论著
1.《四川黔江更新世哺乳动物化石及打制石器》，张兴永、孙智彬、陈祖军，《长江流域第四纪地质及流域综合开发问题学术讨论会论文摘要汇编》，武汉，1986年。
2.《四川秀山发现更新世哺乳动物化石》，张兴永、孙智彬、陈祖军，《长江流域第四纪地质及流域综合开发问题学术讨论会论文摘要汇编》，武汉，1986年。
3.《西南地区的石棺墓分期研究——关于“石棺葬文化”的新认识》，《四川考古论文集》，北京：文物出版社，1996年。
4.《丹巴县中路乡罕额依遗址发掘简报》，四川省文物考古研究所、甘孜藏族自治州文化局，《四川考古报告集》，北京：文物出版社，1998年。
5.《石雕艺术长廊——安丙家族墓地》，《中国十年百大考古新发现》，北京：文物出版社，2002年。
6.《利用近景摄影测量进行安丙家族墓文物考古测绘》，丁军、赵明泽、陈祖军，《工程勘察》2002年第4期。
7.《四川宣汉罗家坝遗址2003年发掘简报》，四川省文物考古研究所、达州地区文物管理所、宣汉县文物管理所，《文物》2004年第9期。
8.《2002年度中日南方丝绸之路考古与文物调查——阿坝州考古调查记》，《四川省における南方シルクロ一ド（南伝仏教の道）の研究.シルクロ一ド学研究》，Vol.24，2005年。
9.《华蓥安丙墓》，四川省文物考古研究院、广安市文物管理所、华蓥市文物管理所，北京：文物出版社，2008年。
10.《四川武胜山水岩崖墓群发掘报告》，四川省文物考古研究院、广安市文物管理所、武胜县文化体育局、武胜县文物管理所，《四川文物》2010年第1期。
11.《西藏清代亚东海关遗址》，《中国考古新发现年度记录2010》，北京：中国文物报社编，2011年。
12.《略论曲贡文化的分期》，《四川文物》2012年第5期。
13.《西南地区的石棺墓分期研究——关于“石棺葬文化”的新认识》，《前吐蕃与吐蕃时代》，文物出版社，2013年。
14.《清朝亚东海关遗址发掘及相关遗存调查报告》，西藏自治区文物保护研究所，《西藏文物考古研究第1辑》，北京：科学出版社，2014年。
15.《汉文史料所见川滇藏古道西藏境内路线考——附〈西藏程站考〉校释》，《西藏文物考古研究第1辑》，北京：科学出版社，2014年。
16.《从华贡山摩崖题刻谈中国中央政府对察隅地区的开发与治理》，《西藏文物考古研究第1辑》，北京：科学出版社，2014年。
17.《定日县绒辖界碑汉文碑刻简释》，田小兰、陈祖军、田红艳、康太浒，《考古与文物》2014年第6期。
18.《青藏高原东部石棺墓遗存初探》，《汉藏佛教美术研究第四届西藏考古与艺术国际学术讨论会论文集》，上海古籍出版社，2014年。
19.《拉萨〈重修札什城关帝庙碑记〉考释》，《西藏文物》2015年第1期。
20.《拉〈磨盘山新建关帝庙碑〉及铜钟铭文重录与相关问题略考》，陈祖军、赤列次仁、旺久，《西藏研究》2015年第2期。
21.《工布江达县“万善同归”碑文考释》，陈祖军、夏格旺堆、李林辉、罗布扎西，《西藏研究》2016年第2期。
获奖情况
1.1997年年初，主持发掘的“安丙家族墓地”被评为1996全国十大考古发现之一。
2.1999年11月，“四川华蓥安丙家族墓地发掘”获国家文物局颁发的1996～1998年度田野考古三等奖。
